絮凝剂的分子质量、分子结构与形状及其所带基团对絮凝剂的活性都有影响。一般来讲，分子量越大，天然氨氮去除剂，絮凝活性越高；线性分子絮凝活性高，分子带支链或交联越多，絮凝性越差；絮凝剂产生菌处于培养后期，细胞表面蔬水性增强，产生的絮凝剂活性也越高。处理水体中胶体离子的表面结构与电荷对絮凝效果也有影响。一些报道指出，水体中的阳离子，天然除磷去除剂，特别是Ca2 、Mg2 的存在能有效降低胶体表面负电荷，促进“架桥”形成。另外，高浓度Ca2 的存在还能保护絮凝剂不受降解酶的作用。微生物絮凝剂高效、安全、不污染环境的优点，天然氨氮去除剂用途，在食品加工、生物产品分离等领域也有巨大的潜在应用价值。
某些天然的高分子有机物例如含羧基较多的多聚糖和含磷酸基较多的淀粉都有絮凝性能。
将天然的高分子物质如淀粉、纤维素、壳聚糖等与烯酰胺进行接枝共聚，聚合物有良好的絮凝性能，或兼有某些特殊的性能。国内研制的一些产品，曾在几个糖厂试用，有较好效果。
目前在国内外糖厂使用最广泛的絮凝剂，是合成的聚烯酰胺系列产品，它们的发展提高较快，在制糖工业的多种流程中普遍使用。
天然絮凝剂具有以下优点：
1、单独使用即可取得很好的絮凝效果，天然氨氮去除剂供应，节省一套加药设备。
2、天然矿物精制而成，没有化学污染物，生态环保。
3、天然絮凝剂用量少，絮凝效果好，生活污水处理用药量为万分之五，大大节省处理成本。
4、天然絮凝剂适应于沉淀、气浮，单组分便于调节药量，减化操作，优其是在气浮工艺中优势更明显。
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